清理柴油发电机组水箱的水垢可以按照以下步骤进行：

关闭发电机组：确保发电机组完全停止运行并断开电源，以确保安全操作。

排空水箱：将水箱中的水全部排空，可以通过水阀或排水口进行排放。确保水箱内没有残留的水。

准备清洗溶液：根据水垢的严重程度，可以选择合适的清洗溶液。常用的清洗溶液包括醋酸、柠檬酸或专用的水垢清洁剂。根据清洗剂的说明，将其与适量的水混合，制成清洗溶液。

清洗水箱：将清洗溶液倒入水箱中，确保水箱内的水垢完全浸泡在溶液中。使用合适的刷子或软布，对水箱内壁进行擦拭和刷洗，特别是水垢严重的地方。可以反复擦拭和刷洗，直到水垢完全清除。

冲洗水箱：使用清水对水箱进行冲洗，确保清洗溶液和水垢都被冲洗干净。反复冲洗几次，直到冲洗水清澈为止。

干燥水箱：将水箱内的水完全排干，可以倒置水箱或使用吹风机进行干燥。确保水箱内干燥，以防止水垢再次形成。

整理和检查：清洁水箱后，整理和检查水箱的其他部分，确保所有的连接和附件都安装正确并处于良好状态。

需要注意的是，清洁水箱时要注意安全，并使用适当的保护措施，如佩戴手套和护目镜。另外，如果您不熟悉清洁水箱的操作，建议咨询专业的发电机组供应商或维修技术人员，以获得更详细和准确的指导。